Prolog gry jest bardzo liniowy, ale po jego ukończeniu zostajemy wrzuceni do otwartego świata podzielonego na pięć regionów, dających nam ogromną swobodę eksploracji. Gracze nie mają obowiązku zaliczania po kolei wszystkich misji fabularnych, tylko mogą zrobić sobie przerwę, aby ukończyć zadania poboczne lub inne dodatkowe aktywności przygotowane przez producenta. Podobnie jak w innych współczesnych RPG-ach, na mapie widnieje wiele znaczników, które warto odwiedzać, żeby zdobyć punkty doświadczenia lub surowce potrzebne do ulepszenia wyposażenia. W Atlas Fallen dostępna jest szybka podróż, lecz można tego dokonać wyłącznie po podejściu do magicznych kowadeł.